是的，机动车违章扣分在某些情况下可以通过申诉撤销。以下是一些常见的可以申诉撤销的情况：

1. 被他人套牌：如果你的车辆被其他车辆套牌（即假牌照），导致违章记录与你的车辆无关，你可以通过提供证据（如车辆照片、行驶证等）进行申诉。

2. 信号灯故障或误判：如果是因为交通信号灯故障或者交警指挥导致的违章行为，你可以申诉撤销。

3. 电子眼抓拍错误：有时候电子眼可能会因为角度、光线等原因误判，导致不该扣分的情况发生。这种情况下可以通过申诉来撤销。

4. 紧急情况下的违章：比如紧急送医、避让事故等特殊情况下的违章行为，可以提供相关证明材料进行申诉。

5. 重复处罚：如果你在同一地点因同一违章行为被多次处罚，可以申诉撤销多余的处罚。

6. 系统错误：有时候由于系统故障或其他技术问题，可能会导致错误的扣分记录，这种情况下也可以申诉撤销。

申诉流程：

1. 收集证据：准备好相关的证据材料，比如行车记录仪视频、照片、交警指挥证明等。

2. 提交申请：登录当地交管部门的官方网站或前往车管所，提交申诉申请，并附上相关证据。

3. 等待审核：交管部门会对你的申诉进行审核，审核结果会通知你。

需要注意的是，并不是所有违章都可以申诉撤销，只有符合上述条件的情况下才有机会成功撤销扣分。因此，在驾驶过程中还是要尽量遵守交通规则，避免不必要的违章行为。